dani type R, yo al principio pensaba lo que tú, e incluso un profesor de mi colegio me lo recalcó, si lleva junta, se le pone junta (la que más te guste, papel, corcho, caucho...) y si lleva pasta pues pasta...Hasta ahi todos de acuerdo, y el error se basa en que la gente pone las juntas, y además echan pastas y tal, y lo que hacen es entorpecer la funcion de la junta, y acortar su vida...
Ahora bien, existen los llamados "selladores de juntas" (los que yo conozco son de las marcas Nural, Wurth) que su función es ayudar a que la junta selle bien por todos los lados, y sobre todo si en alguna de las superficies existen imperfecciones, eso sirve de relleno. Además les cuesta la hostia secarse, están siempre cómo humedas, tu levantas una culata a la que le hayan echado nural oro hace 5 años, pasas el dedo, y no está dura, y por esa razón no afecta para nada a la función ni a la vida de la junta original, es más, están pensadas para que trabajen conjuntamente...

No se si me he explicado bien...SALUDOS