Bueno, si dices que el ruido lo notas al retener el motor seria facil pensar que el tema anda relacionado la caja de cambios/embrague/transmision (palieres). Cuando retienes es el coche el que arrastra al motor y este ofrece una resistencia que se hace patente en el embrague.

A ver, mas cositas que suenen al retener... mira si el motor puede tener los soportes de motor tocados, tambien puedes tener algo del tren delantero mal.

Y por probar mira a ver si te suena a bajas revoluciones rodando en una marcha demasiado larga, o sea, en esas circunstancias pisa el acelerador para obligar al motor a empujar.
No quiero decir mas al respecto para no ser gafe..., no creo que sea nada de motor la verdad.

¿Si aceleras en vacio no se oye ese ruido?