Prueba a ver, metele un filtro de esos transparentes, grande, para ver la cantidad de mierda que absorves, y lleva el deposito bastante lleno para que la fuerza extra que tenga que hacer la bomba para aspirar se contrarreste con la columna de liquido del deposito.
Y si te preocupa mucho el deposito, metele una bomba externa con varios filtros en paralelo y ten recirculando la gasolina un tiempo, a ver si consigues limpiar.