Yo lo tengo instalado nativo en el Windows 7 64bit y 0 problemas.

Instalados los msi tal cual como comentas, pero luego el archivo configurator ese lo copiaba en la C:\ y lo ejecutaba des de ahí.
También con CMD como administrador, pero es solo para que ese .jar tenga permisos de escritura en C:\Program Files (x86)\...


Has mirado en las "Herramientas Administrativas > Servicios" que el servicio relacionado al EPC esté arrancado?

1 saludo