lo que tienes que hacer es cambiar la polea del alternador que has pillado por la del que tenias antes, asi seguro que te queda alineado.
Yo he cambiado al mio el alternador y le he puesto otro que tenia por la lonja de 70 amperios, y la polea era de un vectra y se encajaba la polea en la polea exterior del cigüeñal, cosa que me es imposible dado que ahí esta la correita de la asistida, asi que cambio de una por otra y queda alineado